Bei Anwendungsbeobachtungen arbeiten Ärzte und die Pharmaindustrie eng zusammen. Der Arzt verschreibt bestimmte Arzneimittel und beobachtet die Reaktion der Patienten auf dieses. Man möchte Kenntnisse, die beim Einsatz bestimmter Arzneimittel gemacht wurden, systematisch sammeln und analysieren.

Der Arzt erhält von dem Hersteller eine Entschädigung für seinen zusätzlich entstandenen Aufwand. Damit dieses Modell nicht zum Missbrauch genutzt wird, wird der ganze Vorgang streng von den Krankenkassen überwacht. Es werden grundsätzlich alle Verschreibungen, die aufgrund einer Anwendungsbeobachtung durchgeführt worden sind, einer Wirtschaftlichkeitsprüfung unterzogen.

Zudem hat der Arzt alle Entschädigungen, die er in Zusammenarbeit mit dem Pharmahersteller erhält, an die Kassenärztliche Bundesvereinigung und den Spitzenverband Bund der Krankenkassen zu melden.